Có 6 chi cheo cheo đã tuyệt chủng[12] gồm:

• Chi Dorcatherium
  • Dorcatherium minus ở Pakistan
  • Dorcatherium majus ở Pakistan
  • Dorcatherium nani Kaup ở Trung Âu[13]
• Chi Dorcabune
  • Dorcabune anthracotherioides ở Pakistan
  • Dorcabune nagrii ở Pakistan
• Chi Afrotragulus Sánchez, Quiralte, Morales and Pickford, 2010 [14]
  • Afrotragulus moruorotensis (trước đây thuộc "Dorcatherium", Pickford, 2001) (đầu Miocene) ở Moruorot, Kenya
  • Afrotragulus parvus (trước đây thuộc "D.", Withworth 1958) (đầu Miocene) ở Đảo Rusinga, Kenya
• Chi Siamotragulus
  • Siamotragulus sanyathanai Thomas, Ginsburg, Hintong và Suteethorn, 1990 (giữa Miocene) ở Lampang, Thái Lan
  • Siamotragulus haripounchai Mein and Ginsburg, 1997 (Miocene) ở Lamphun, Thái Lan
• Chi Yunnanotherium
• Chi Archaeotragulus[15]
  • Archaeotragulus krabiensis Metais, Chaimanee, Jaeger and Ducrocq, 2001 (cuối Eocene) ở Krabi, Thái Lan

và có thể bao gồm[16][17]

• Chi Krabitherium[18]
  • Krabitherium waileki Metais, Chaimanee, Jaeger and Ducrocq, 2007 (cuối Eocene) ở Krabi, Thái Lan

Họ Hypertragulidae có quan hệ họ hàng rất gần với họ Tragulidae.